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GelGreen
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GelGreen

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GelGreen
GelGreen chemical structure.png
General
Otros nombres 10,10'-(6,22-dioxo-11,14,17-trioxa-7,21-diazaheptacosano-1,27-dil)bis(3,6-bis(dimetilamino)acridin-10-inio) yodato
Fórmula molecular C56H80I2N8O5
Identificadores
ChemSpider 10032003
PubChem 11857532
O=C (NCCCOCCOCCOCCCNC(CCCCC[N+]1=C2C(C=CC(N(C)C)=C2)=CC3=C1C=C(N(C)C)C=C3)=O)CCCCC[N+]4=C5C(C=CC(N(C)C)=C5)=CC6=C4C=C(N(C)C)C=C6.[I-].[I-]
Propiedades físicas
Masa molar 1198.43 g/mol g/mol
Valores en el SI y en condiciones estándar
(25 y 1 atm), salvo que se indique lo contrario.

El GelGreen es un intercalante utilizado para teñir ácidos nucleicos en biología molecular para electroforesis en gel de agarosa. GelGreen está estructuralmente relacionado en forma estrecha con el naranja de acridina, y consiste en dos subunidades de naranja de acridina que se puentean mediante un espaciador.​ El GelGreen permite teñir dsADN, ssADN o ARN.

Su fluoróforo, y por lo tanto sus propiedades ópticas, son esencialmente idénticas a los de otros compuestos del tipo naranja N-alquilacridina. Cuando se expone a la luz ultravioleta, presenta fluorescencia con un color verdoso que se intensifica fuertemente tras la unión a ADN.​ La sustancia se comercializa como una alternativa menos tóxica y más sensible que el intercalante bromuro de etidio. El GelGreen se vende como una solución en DMSO o, más recientemente, en forma acuosa.

Características fisicoquímicas

Característica Valor
Fuerza por puente de hidrógeno aceptor 9
Fuerza por puente de hidrógeno donador 2
Número de giros 30
Coeficiente de reparto 2.7
Solubilidad (logS (mol/l)) -12.9
Superficie polar (Å 2) 205.1

Véase también

Enlaces externos



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