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Base de datos biológica
CoDIS
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CoDIS

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CoDIS
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Información general
Tipo Base de datos
Software
Gestión
Propietario Federal Bureau of Investigation

Combined DNA Index System (CoDIS) es la base de datos nacional de EE. UU., creada y mantenida por el FBI. El CoDIS comprende tres niveles de información: sistemas de índice de ADN locales (LDIS) donde se originan los perfiles genéticos, sistemas de índice de ADN estatales (SDIS) que permite a los laboratorios de un mismo estado compartir información, y el sistema de índice de ADN nacional (NDIS) que permite a los estados comparar información entre ellos.

El software del CoDIS contiene diferentes bases de datos dependiendo del tipo de información a buscar, que incluyen personas desaparecidas, delincuentes y muestras forenses de escenas de delito. Cada estado, y el sistema federal, tiene diferentes leyes que regulan la recolección, subida y análisis de la información contenida en su base de datos. Sin embargo, por razones de privacidad, la base de datos CoDIS no contiene información personal identificativa, como el nombre asociado a cada perfil genético.

Orígenes

El CoDIS era una extensión de Grupo de Trabajo Técnico en Métodos de Análisis del ADN (TWGDAM, ahora SWGDAM) que desarrolló guías normalizadas para la práctica en laboratorios forenses en EE. UU. y Canadá, cuando comenzaron a trabajar con muestras de ADN en los años 80.

El TWGDAM fue patrocinado por el laboratorio del FBI que organizaba diversos encuentros científicos al año en Quantico, Virginia, para acelerar el desarrollo de guías de laboratorio y revisar artículos para apoyar los ensayos de ADN, que para algunos eran una herramienta forense dudosa. El TWGDAM completó un libro blanco en octubre de 1989 que daba autoridad al CoDIS para compartir perfiles de ADN entre laboratorios, de igual forma que ya se hacía con las huellas dactilares en la misma década.

El laboratorio del FBI comenzó un proyecto piloto en seis estados y laboratorios forenses locales para desarrollar un software que diera soporte a las pruebas de ADN en cada laboratorio y que permitiera compartir perfiles genéticos con otros laboratorios.

La asamblea de identificación de ADN de 1994 autorizó el establecimiento de este índice nacional de ADN. La asamblea especifica las categorías de datos que pueden almacenarse en el NDIS (delincuentes convictos, arrestados, detenidos, casos forenses, restos humanos sin identificar, personas desaparecidas y familiares de estas), así como los requerimientos para los laboratorios participantes, relacionados con la garantía de calidad, privacidad y borrado de datos.

La asamblea especifica los requerimientos de acceso a las muestras de ADN y archivos mantenidos por las agencias criminales de justicia federales, estatales y locales (o la Secretaría de Defensa, de acuerdo con la sección 1565, título 10 del código de los Estados Unidos).

Las leyes federales requieren que los laboratorios que suministren datos al NDIS esté acreditados por asociaciones profesionales sin ánimo de lucro o por personas activamente involucradas en ciencia forense, internacionalmente reconocidas por la comunidad forense. Las siguientes entidades han cumplido esta definición: la American Society of Crime Laboratory Directors/Laboratory Accreditation Board (ASCLD/LAB) y los Servicios de Calidad Forenses.

Bases científicas

La identificación en el CoDIS se basa en las repeticiones cortas en tándem (STR) presentes en el genoma humano, de entre dos y seis nucleótidos, muy susceptibles a variación en el número de repeticiones. Los loci donde se encuentran las STR pueden amplificarse usando PCR y analizarse mediante electroforesis en gel. El tamaño del fragmento de ADN es proporcional al número de repeticiones, por lo que podrán cuantificarse estas. La combinación de repeticiones en cada locus proporciona una huella genética característica de cada individuo.

Marcadores

Marcadores genéticos usados por el CoDIS.

El CoDIS identifica marcadores genéticos en trece STR, además del locus de la amelogenina (presente en los cromosomas X e Y y adecuado para determinar el sexo).

  • CSF1PO
  • D3S1358
  • D5S818
  • D7S820
  • D8S1179
  • D13S317
  • D16S539
  • D18S51
  • D21S11
  • FGA
  • TH01
  • TPOX
  • vWA

A partir del 1 de enero de 2017 se agregaron siete ubicaciones más ​

  • D1S1656
  • D2S441
  • D2S1338
  • D10S1248
  • D12S391
  • D19S433
  • D22S1045

Estos marcadores no solapan con los que ese usan generalmente en ensayos de ADN. Algunos pueden ser indicadores de enfermedades genéticas.

El índice del CoDIS asiste a los laboratorios forenses públicos de EE. UU. para comparar e intercambiar perfiles de ADN. Uno de sus registros, el "CODIS DNA profile", consiste en el perfil genético de un individuo, junto con el de la muestra identificativa y el identificador del laboratorio responsable del perfil. El CoDIS no es una base de datos histórica sobre delitos, como puede ser el Centro Nacional de Información Criminal (NCIC), y no contiene información personal identificativa como nombres, fechas de nacimiento o números de la seguridad social.

Originariamente, el CoDIS consistía en el índice de criminales convictos y el índice forense, pero actualmente se han añadido el índice de arrestados, el índice de personas desaparecidas o no identificadas, y el índice de referencia de personas desaparecidas.

El CoDIS tiene un algoritmo de coincidencias de búsquedas entre varios índices, de acuerdo con las reglas estrictas de protección de datos. A la hora de resolver violaciones y homicidios por ejemplo, el CoDIS compara el índice forense con el de criminales. El algoritmo solo genera una lista de candidatos, que puede ser confirmado o descartado por un analista cualificado.

Las bases de datos del CoDIS existen a nivel local, estatal y nacional. Esta estructura permite a los laboratorios controlar sus propios datos: cada laboratorio decide qué perfiles compartir con el resto del país. Desde 2006, aproximadamente 180 laboratorios de los cincuenta estados participan en el CoDIS. A nivel nacional, el sistema de índice nacional de ADN (NDIS) lo regenta el FBI en una localización sin revelar.

Tamaño relativo

El NDIS contiene más de 12 010 904 perfiles, 2 157 394 perfiles de arrestados y 663 191 perfiles forenses a fecha de octubre de 2015. Por último, el éxito del programa CoDIS se mide en el número de delitos que ayuda a resolver. "CoDIS primary metric" sigue el número de investigaciones criminales en las que el CoDIS ha contribuido al proceso de investigación. Hasta octubre de 2015, el CoDIS ha generado más de 300 050 asistencias en más de 285 447 investigaciones.

Loci

Las ubicaciones se encuentran registradas en el NIST Instituto Nacional de Estándares y Tecnología ​

Texto de la leyenda
Marcador Otros nombres Ubicación Cromosomal Genbank Accession Loci Genoma Estructura repetida Primers Referencia
CSF1PO CSF, UniSTS: 156169 5q33.1 X14720 Chr 5; 149.436 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [AGAT] 5'-AACCTGAGTCTGCCAAGGACTAGC-3' (AGAT hebra), 5'-TTCCACACACCACTGGCCATCTTC-3' (TCTA hebra) https://strbase.nist.gov/str_CSF1PO.
FGA FIBRA, UniSTS: 240635 4q28 M64982 Chr 4; 155.866 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [TTTC]3TTTTTTCT[CTTT]nCTCC[TTCC]2 5'-GCCCCATAGGTTTTGAACTCA-3' (CTTT hebra), 5'-TGATTTGTCTGTAATTGCCAGC-3' (GAAA hebra) https://strbase.nist.gov/str_FGA.
TH01 HUMTH01, TC11, UniSTS: 240639 11p15.5 D00269 Chr 11; 2.149 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [AATG] 5'-GTGGGCTGAAAAGCTCCCGATTAT-3' (AATG hebra) , 5'-ATTCAAAGGGTATCTGGGCTCTGG-3' (TCAT hebra) https://strbase.nist.gov/str_TH01.
TPOX hTPO, TPO, UniSTS: 240638 2p25.3 M68651 Chr 2; 1.472 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [AATG] 5'-ACTGGCACAGAACAGGCACTTAGG-3' (AATG hebra), 5'-GGAGGAACTGGGAACCACACAGGT-3' (TTAC hebra) https://strbase.nist.gov/str_TPOX.
VWA vWF, VWA31A, UniSTS: 240640 12p13.31 M25858 Chr 12; 5.963 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [TCTA] with [TCTG] and [TCCA] inserts 5'-CCCTAGTGGATAAGAATAATC-3' , 5'-GGACAGATGATAAATACATAGGATGGATGG-3' https://strbase.nist.gov/str_VWA.
D3S1358 UniSTS: 148226 3p21.31 AC099539 Chr 3; 45.557 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [AGAT], [TCTA] 5'-ACT GCA GTC CAA TCT GGG T-3' (AGAT hebra), 5'-ATG AAA TCA ACA GAG GCT TG-3' (TCTA hebra) https://strbase.nist.gov/str_D3S1358.
D5S818 D5 UniSTS: 54700 5q23.2 G08446, AC008512 Chr 5; 123.139 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [AGAT] 5'-GGTGATTTTCCTCTTTGGTATCC-3', 5'-[JOE]-AGCCACAGTTTACAACATTTGTATCT-3' https://strbase.nist.gov/str_D5S818.
D7S820 , , D7, , UniSTS: 74895 7q21.11 G08616, AC004848 Chr 7; 83.433 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [GATA] 5'-[JOE]-ATGTTGGTCAGGCTGACTATG-3', 5'-GATTCCACATTTATCCTCATTGAC-3' https://strbase.nist.gov/str_D7S820.
D8S1179 D6S502, , UniSTS: 83408 8q24.13 G08710, AF216671 Chr 8; 125.976 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [TATC] 5' - TTTTTGTATTTCATGTGTACATTCG - 3', 5' - CGTAGCTATAATTAGTTCATTTTCA - 3' https://strbase.nist.gov/str_D8S1179.
D13S317 , , D13, , UniSTS: 7734 13q31.1 G09017, AL353628.2 Chr 13; 81.620 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [GATA] 5'-ATTACAGAAGTCTGGGATGTGGAGGA-3', 5'-[JOE]-GGCAGCCCAAAAAGACAGA-3' https://strbase.nist.gov/str_D13S317.
D16S539 D16, , UniSTS: 45590 16q24.1 G07925, AC024591.3 Chr 16; 84.944 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [GATA] 5'-GGGGGTCTAAGAGCTTGTAAAAAG-3', 5'-[JOE]-GTTTGTGTGTGCATCTGTAAGCATGTATC-3' https://strbase.nist.gov/str_D16S539.
D18S51 D18S379; UT574, , UniSTS: 44409 18q21.33 X91254, AP001534 Chr 18; 59.100 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [GAAA] 5'-CAA ACC CGA CTA CCA GCA AC-3' (GAAA hebra), 5'-GAG CCA TGT TCA TGC CAC TG-3' https://strbase.nist.gov/str_D18S51.
D21S11 UniSTS: 240642 21q21.1 M84567, AP000433 Chr 21; 19.476 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [TCTA], [TCTG] 5'-GTG AGT CAA TTC CCC AAG-3', 5'-GTT GTA TTA GTC AAT GTT CTC C-3' https://strbase.nist.gov/str_D21S11.
D1S1656 UniSTS: 58809 1q42 G07820 Chr 1; 228.972 Mb [TAGA]n[TGA]0-1[TAGA]n[TAGG]0-1[TG]5 5'-GTGTTGCTCAAGGGTCAACT-3', 5'-[FL]-GAGAAATAGAATCACTAGGGAACC-3' https://strbase.nist.gov/str_D1S1656.
D2S441 D2S1778, CHLC.GATA72A05, , UniSTS:71306 2p14 AC079112 chr 2: 68,213,613 bp Julio 2003, NCBI ensamblaje del genoma humano [TCTA] 5'-TGCACCCAACATTCTAACAA-3', 5'-ATTGGAGCTAAGTGGCTGTG-3' https://strbase.nist.gov/str_D2S441.
D2S1338 UniSTS: 30509 2q35 AC010136, G08202 Chr 2; 218.705 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 [TGCC]n[TTCC]n https://strbase.nist.gov/str_D2S1338.
D10S1248 CHLC.GGAA23C05 10q26.3 AL391869 chr 10: 130,566,908 bp Julio 2003, NCBI ensamblaje del genoma humano [GGAA]n 5'-GGAATAAGTGCAGTGCTTGG-3', 5'-ACCAATCTGGTCACAACCAT-3' https://strbase.nist.gov/str_D10S1248.
D12S391 CHLC.GATA 11 HO8., UniSTS: 2703 G08921 Chr 12; 12.341 Mb [AGAT]8-17[AGAC]6-10[AGAT]0-1 5'-AACAGGATCAATGGATGCAT-3', 5'-TGGCTTTTAGACCTGGACTG-3' https://strbase.nist.gov/str_D12S391.
D19S433 CHLC.GGAA2A03, UniSTS: 33588 19q12 G08036, AC008507.6 Chr 19; 35.109 Mb Mayo 2004, NCBI ensamblaje 35 (AAGG)(AAAG)(AAGG)(TAGG)[AAGG]n https://strbase.nist.gov/str_D19S433.
D22S1045 CHLC.ATA37D06 22q12.3 AL022314 chr 22: 35,779,368 bp Julio 2003, NCBI ensamblaje del genoma humano [ATT]n 5'-GCTAGATTTTCCCCGATGAT-3', 5'-ATGTAAAGTGCTCTCAAGAGTGC-3' https://strbase.nist.gov/str_D22S1045.

Enlaces externos

https://www.fbi.gov/services/laboratory/biometric-analysis/codis


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