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Software libre en bioinformática
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Software libre en bioinformática

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BroadEsta es una lista de software bioinformático y publicado bajo licencia de software de código abierto.

Software Descripción Plataforma Licencia Desarrollador
.NETO Bio Set de herramientas basado en Microsoft 4.0 .NET para ayudar desarrolladores, investigadores, y científicos .Marco NETO Apache Proyecto colaborativo
ÁNFORA Software de análisis de Metagenómica Linux GPL
Anduril Sistema de flujo de trabajo para análisis de datos orientado a objetos. Linux, macOS, Windows GPL Universidad de Helsinki
Ascalaph Diseñador Programa de ordenador de propósito general para modelado molecular, simulación y diseño molecular. GPLv2 Agile Molecule
AutoDock Paquete de software para realizar docking GNU/Linux, macOS, IRIX, and Microsoft Windows GPL Instituto de Investigación Scripps
Avogadro Editor y visualizador de moléculas GPL Proyecto colaborativo
Bioclipse Plataforma visual para chemo- y bioinformatica basado en la Plataforma Eclipse de Cliente Rico (RCP) Pública de eclipse El Proyecto Bioclipse
Bioconductor Paquete de herramientas para lenguaje R Linux, macOS, Windows Artístico 2.0 Fred Hutchinson Centro de investigación del Cáncer
BioJava Paquete de herramientas para lenguaje Java Linux, macOS, Windows LGPL v2.1 Fundación bioinformática abierta
BioJS Paquete de herramientas para lenguaje Javascript Navegador de web Apache Proyecto colaborativo
BioMOBY Registro de servicios web Navegador de web Artístico Fundación bioinformática abierta
BioPerl Paquete de herramientas para lenguaje Perl Multiplataforma Artístico, GPL Fundación bioinformática abierta
BioPHP Paquete de herramientas para lenguaje PHP GPL v2 Fundación bioinformática abierta
Biopython Paquete de herramientas para lenguaje Python Multiplataforma Biopython​ Fundación bioinformática abierta
BioRuby Paquete de herramientas para lenguaje Ruby GPL v2 o Ruby Fundación bioinformática abierta
CP2K Simulación atomística de sistemas de estado sólido, líquido, moleculares y biológicos GPL Y LGPL Código abierto libre GNU GPLv2 o más tarde
EMBOSS Conjunto de paquetes para secuenciación y búsqueda bioinformática GPL Y LGPL Proyecto colaborativo
Galaxia Sistema de integración de datos y Flujo de trabajo científico Estilo Unix Académico Libre Proyecto colaborativo
GenePattern Sistema de flujo de trabajo científico que proporciona cientos de herramientas de análisis genómico Estilo Unix (servidor público); Linux, macOS, Windows MIT Instituto Broad , UC San Diego
Geworkbench Plataforma de integración de dato genómica Linux, macOS, Windows GeWorkbench Licencia​ Columbia Universidad
GMOD Toolkit Para dirigir muchos retos comunes en bases de datos biológicas Estilo Unix (servidor), navegador de Web (cliente) Varía depende de la herramienta Proyecto colaborativo
GenGIS Sistema para combinar información de mapas con secuencias biológicas. Windows, macOS GPL Proyecto colaborativo
Genomespace Aplicación web centralizada que proporciona transformaciones de formato del dato y facilita conexiones con otras herramientas bioinformáticas Navegador de web LGPL Instituto Broad, Proyecto colaborativo
Suave Un equivalente al software propietario Vector , herramienta para analizar y editar archivos de secuencia del ADN GPL Magnus Manske
GROMACS Paquete de dinámica molecular principalmente diseñado para simulacros de proteínas, lípidos y ácidos nucleicos. Linux, macOS, Windows Público común 1.0 GenoViz
Integrated Genome Browser Navegador de genoma de escritorio basado en Java Linux, macOS, Windows Público común 1.0 GenoViz
InterMine Sistema de almacén de dato extenso, para el análisis e integración de datos biológicos Multiplataforma LGPL Universidad de Cambridge
LabKey Servidor Plataforma de software, deja organizaciones para integrar, analiza, y compartir complejo biomedical dato Linux, macOS, Windows Apache Fundación de software LabKey
LAMMPS Programa de dinámica molecular Linux, macOS, Windows Apache Laboratorio Nacional de Sandia
mothur Software para análisis del rRNA 16S Linux, macOS, Windows Universidad de Míchigan
PathVisio Software de escritorio para dibujar, analizar y visualizar rutas biológicas Linux, macOS, Windows Apache 2.0 Universidad de Maastricht
Naranja software de aprendizaje automático, con interfaz gráfica interactiva para análisis exploratorio de datos y librerías de Python Linux, macOS, Windows GPL Universidad de Ljubljana
Staden Ensamblaje de secuencia, edición y análisis, principalmente constando de gap4, ga5, y espín. Linux, macOS, Windows BSD Consejo de investigaciones médicas del Fondo Wellcome, Instituto Sanger Instituto.
Banco de trabajo Taverna Herramienta para diseñar y ejecutar workflows Linux, macOS, Windows LGPL myGrid
UGENE Herramientas bioinformaticas varias Linux, macOS, Windows GPL 2 Unipro
Unipept Análisis de biodiversidad de metaproteomas Navegador de web MIT Universidad Ghent
VOTCA Paquete de modelado molecular de grano grueso GNU/Linux, macOS, Windows, cualquiera otra variedad de Unix Licencia de apache 2.0 Instituto Max Planck para investigación en Polímeros

Véase también

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