Endonucleasas homing de restricción

Las endonucleasas homing son un tipo especial de enzimas de restricción codificadas por intrones o inteínas, que actúan sobre el DNA de la propia célula que las sintetiza.​

Para más información, consultar el artículo principal endonucleasas homing.

Lista de endonucleasas homing de restricción

En esta lista se incluyen algunos de los ejemplos más estudiados, detallándose los siguientes conceptos:

• Enzima: Nombre de la enzima, según la nomenclatura aceptada y adoptada internacionalmente; y referencias bibliográficas correspondientes. (Para más detalles, consultar la sección Nomenclatura del artículo endonucleasas homing.)
• SF: Familia estructural: una de las cuatro familias determinadas para esta clase de proteínas, sobre la base de sus motivos compartidos: HI: familia LAGLIDADG – HII: familia GIY-YIG – HIII: familia H-N-H – HIV: familia His-Cys box. (Para más detalles, consultar la sección Familias estructurales del artículo endonucleasas homing.)
• Código PDB: Código empleado para identificar la estructura de la proteína en la base de datos «PDB». 
• Origen: Organismo que genera la enzima de forma natural (o bien artificialmente si la enzima es sintética).
• D: Dominio biológico del organismo origen: A: arqueas – B: bacterias – E: eucariotas.
• LSC: Localización subcelular: cloro: cloroplastidial – crm: cromosomal – mito: mitocondrial – nuclear: nuclear extracromosomal – fago: bacteriofago.
• Secuencia de reconocimiento: Secuencia de DNA que la enzima reconoce y a la que se une específicamente.
• Secuencia de corte: Secuencia de corte y producto del corte. Normalmente la secuencia de reconocimiento y la de corte coinciden, pero en algunos casos esta última puede encontrarse docenas de nucleótidos alejada de la primera.

*: Endonucleasa que corta en una sola hebra de DNA: Estas enzimas cortan sólo una de las dos hebras del DNA, dejando la otra intacta. Se las podría denominar "endonucleasas pellizcadoras", de su denominación original anglosajona "nicking endonuclease".
**: Secuencia de corte desconocida: La investigación acerca de esta enzima no ha conseguido revelar aún su secuencia de corte concreta.

Enlaces externos

Bases de datos y listas de enzimas de restricción:

• Base de datos exhaustiva de enzimas de restricción y endonucleasas homing ubicada en los servidores de New England Biolabs©. Incluye toda clase de información biológica, estructural, cinética y comercial acerca de miles de enzimas. También incluye referencias bibliográficas especializadas para cada molécula: Roberts RJ, Vincze T, Posfai, J, Macelis D. «REBASE». Consultado el 7 de enero de 2010. «Restriction Enzyme Database. » 
• Base de datos de inteínas, alojada en la página web de New England Biolabs©. Perler FB. «InBase». Consultado el 5 de febrero de 2010. «The Intein Database and Registry ». .​
• Información detallada para experimentos bioquímicos: «Enzyme finder». Consultado el 7 de enero de 2010. «New England Biolabs© enzyme finder. » 

Bases de datos de proteínas:

• Base de datos de estructuras de proteínas, resueltas a estructura atómica: «PDB». Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB). Consultado el 25 de enero de 2010. «RCSB Protein Data Bank. » 
• Bases de datos generales de proteínas: Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) & European Bioinformatics Institute (EBI). «UniProtKB/Swiss-Prot & TrEMBL». Consultado el 25 de enero de 2010. «Swiss-Prot es una base de datos de proteínas con un gran nivel de supervisión y anotación, un mínimo nivel de redundancia y un elevado nivel de integración con otras bases de datos. Swiss-Prot describe, tanto la función de la proteína, como su estructura de dominios, modificaciones post-transcripcionales, variantes, etc. TrEMBL es un suplemento a Swiss-Prot, anotado de forma automatizada, que contiene todas las traducciones de las entradas recogidas en las bases de datos del EMBL que no han sido aún integradas en Swiss-Prot. » 

Véase también

• Endonucleasa homing.
• Lista de sitios de corte de enzimas de restricción.
• Enzima de restricción.
• Intrón e inteína.
• Transposón